水性聚氨酯材料最大的优势在于其分子结构的可控性，我们可以根据需要制备不同性能的水性聚氨酯材料。 影响水性聚氨酯材料性能的首要因素是基团的内聚能，基团的内聚能与力学性能和软化点密切相关，分子结构中基团的内聚能越大，相应材料的力学性能越好。 软化点越高。 脲基和氨基甲酸酯基的内聚能较高，其次是酯基、羟基、羧基，脂肪烃和醚基的内聚能较低。
影响研究材料进行力学系统性能的另一个主要因素是分子中氢键的存在,氢键是一种学习物理吸附力,不同于化学键形成合力,它的存在能起到一个物理交联的作用,提高我国水性聚氨酯弹性体的强度及耐磨顺性能。结晶性也是社会影响建筑材料使用性能的重要经济因素,分子利用结构越规整。极性及刚性基团含量越来越多,材料的结晶技术性能也相应能力越好,一般企业来说就是水性聚氨酯复合材料的强度、硬度、耐溶剂性能、软化点随着文化结晶程度的增加而增加,而断裂伸长率和溶解性能则随结晶程度的增加而降低。
为了获得综合性能更好的水性聚氨酯材料，可以在制备过程中加入交联剂使其适度交联，从而提高材料的硬度、弹性模量和软化温度。交联剂过量加入时，容易造成材料的断裂伸长率、溶解性和永久变形急剧下降，所以一定要注意交联剂的加入量。对于分子量来说，主要会影响线型水性聚氨酯弹性体的性能，但是对于高交联度的水性聚氨酯泡沫来说，分子量不是影响其性能的主要因素。分子量越高，相应材料的拉伸强度、断裂伸长率和硬度越高。影响水性聚氨酯材料性能的另一个主要因素是温度，温度主要影响链段的规整性。同时，高温容易使线性分子链支化交联，低温更有利于氢键的形成。